В університеті видається 26 наукових видань, з них 18 фахові

У 2013 р. видано 34 збірники наукових праць «Науковий вісник НУБіП України» з одинадцяти серій загальним обсягом 650 обл.-вид. арк. У них надруковано 1411 статей, у тому числі підготовлено працівниками НУБіП України – 970, з них аспірантами – 347, магістрами – 84, студентами – 62. У звітному році видано: - 6 номерів наукового журналу «Біоресурси і природокористування»; - 6 номерів електронного журналу «Наукові доповіді НУБіП України»; - 12 номерів науково-виробничого журналу «Сучасне птахівництво»; - 4 номери електронного фахового журналу з технічних наук «Енергетика і автоматика»; - 2 номери електронного наукового журналу «Лісове і садово-паркове господарство». Спільно з іншими засновниками видаються: науковий журнал «Мікробіологічний журнал»; науково-виробничий журнал «Облік і фінанси АПК»; науково-практичний журнал «Продовольча індустрія АПК»; науково-виробничий журнал «Землеустрій, кадастр і моніторинг земель»; науковий журнал «Вісник аграрної історії» та ін..

Видано 3 номери міжнародного електронного журналу «Біоресурси планети та якість життя». Також видається наукове фахове видання України «Наукові праці Південного філіалу НУБіП України «Кримський агротехнологічний університет» (серії «Економічні науки», «Ветеринарні науки», «Сільськогосподарські науки»).