Читання курсу з селекції рослин розпочалося професором Колкуновим В.В. на кафедрі загального землеробства сільськогосподарського відділення КПІ в 1912 р. Як самостійний підрозділ кафедра селекції та насінництва офіційно була створена в 1936 р., її очолив доктор с.-г. наук, професор Лебедєв В.М. - відомий генетик і селекціонер, соратник Вавилова М.І. Розробки наукової школи Лебедєва В.М. були пов'язані з цитологічними генетико-селекційними дослідженнями з віддаленої гібридизації.
        З 1948 р. кафедрою керував кандидат біологічних наук доцент Плесецький П.Ф. У 1949р. кафедру було приєднано до кафедри фізіології рослин і мікробіології, якою завідував доцент Завгородній Ф.І. У 1952 р. кафедру селекції та насінництва очолив Заслужений працівник вищої школи, доктор сільськогосподарських наук, професор Зеленський М.О., автор більше 100 наукових та методичних розробок в галузі селекції та насінництва с.-г. культур. Протягом 1987 по 1993 рр. кафедру очолював доцент канд. с.-г. наук Пархоменко А.К., а з 1993 р. – доктор біологічних наук, професор Тараненко Л.К. Із січня 1998 до 2000 рр. кафедрою завідувала доктор біологічних наук Чугункова Т.В. У 1998 році кафедру селекції було об'єднано з кафедрою фізіології рослин, а з січня 2001 р. вона знову стала самостійною.
      У різні часи на кафедрі працювали: член.-кор. ВАСГНІЛ Кузьменко М.В. (1981-1986 рр.), проф. Губернатор В.В. (1968-1998 рр.), проф. Бобер А.Ф. (1994-1997).
        Із жовтня 2000 року кафедру генетики, селекції і насінництва, яка з 2002 р. почала носити ім’я проф. Зеленського М.О. очолив кандидат сільськогосподарських наук, Відмінник освіти України, доцент  Жемойда В.Л., автор більше 180 наукових праць, співавтор та автор 18 гібридів і сортів кукурудзи, джерел та донорів озимих пшениці та жита, господарсько-цінних ознак. 

У 2011 році кафедру очолив кандидат біологічних наук Парій М.Ф.,  з вересня 2014 року - Жемойда В.Л. Розпочався новий етап розвитку із залученням сучасних методів молекулярної генетики та біотехнології в навчальну та наукову роботу кафедри. Основними напрямами наукових досліджень науковців кафедри є розробка питань прикладної генетики, методів селекції та насінництва і створення високопродуктивних сортів та високогетерозисних гібридів сільськогосподарських культур.
     Кафедра готує фахівців ОКР "Бакалавр" та "Магістр" напряму «Агрономія» за спеціальностями «Агрономія» та «Селекція і генетика», зі спеціалізаціями «Селекція і генетика», «Сортовивчення та охорона прав на сорти рослин» і «Селекція та насінництво».
       На теперішній час педагогічну та наукову роботу на кафедрі здійснюють: в. о. завідувача кафедри, кандидат сільськогосподарських наук Макарчук О.С., заслужений науково-педагогічний працівник НУБіПУ, доцент, кандидат сільськогосподарських наук Жемойда В.Л., професор, доктор сільськогосподарських наук, академік НААН України Роїк М.В., професор, доктор сільськогосподарських наук, Ковалишина Г.М., доцент, кандидат біологічних наук, Відмінник освіти України Башкірова Н.В.,  старший викладач, кандидат сільськогосподарських наук Ткачик С.О., старший викладач, кандидат сільськогосподарських наук, Зінченко О.А., доцент, кандидат сільськогосподарських наук Сень О.В., доцент, кандидат сільськогосподарських наук Альохін В.І., асистент Дмитренко Ю.М.