Кафедра фітопатології ім. академіка В.Ф. Пересипкіна має чи не найдавнішу історію серед існуючих на сьогодні кафедр НУБіПУ. Навчальна та наукова діяльність розпочалася на кафедрі з 1954 року за наказом в.о. ректора Української ордена Трудового Червоного Прапора сільськогосподарської академії В.Ф. Пересипкіна № 23 від 7 вересня 1954 року. Організатором кафедри та першим її керівником був професор В.Ф. Пересипкін. У різні роки кафедру очолювали: академік УААН В.Ф. Пересипкін (1954 р., 1956-1968 рр., 1972-1986 рр.), доцент В.М. Братусь (1954-1955 рр.), академік НААН України М.М. Кирик (1968-1972 рр., 1986-2007 рр.), доцент М.Й. Піковський (2007-2009 рр.), д.с.-г.н., старший науковий співробітник О.Ф. Антоненко (2009-2014 рр.), д.б.н., старший науковий співробітник Л.О. Крючкова (2016-2018 рр.). З жовтня 2018 р. кафедру очолює к.с.-г.н, доцент Гентош Д.Т.
Протягом тривалої історії свого існування на кафедрі створювалася колекція зразків рослин, уражених різними хворобами. Сьогодні це справжній музей, якому немає аналогів в Україні.
В науково-навчальній лабораторії зберігається велика колекція штамів грибів-збудників хвороб рослин.
